Авторы: О. Б. Райзер, О. Н. Хапилина
Национальный центр биотехнологии, Нур-Султан, Республика Казахстан E-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Аннотация. Цель исследования – оценка генетического полиморфизма казахстанских популяций редких реликтовых и эндемичных видов Allium. Новизна исследований заключается в использовании современного молекулярногенетического iPBS (Inter-Primer Binding Site Polymorphism) метода амплификации ДНК, для оценки генетического разнообразия различных популяций Allium, собранных в местах их естественного произрастания на территории Казахстанского Алтая. Методы. В качестве объектов исследований были использованы лекарственные реликтовые и исчезающие виды лука (A. ledebourianum, A. altaicum, A. microdiction), собранные в местах их естественного произрастания на территории Казахстанского Алтая. ДНК выделяли из 3–5-дневных стерильных проростков лука с использованием лизирующего СТАВ-буфера c РНКазой А. В работе использовали PBS-праймеры для оценки генетического разнообразия различных популяций Allium. Оценку результатов амплификации, полученных с использованием различных PBSпраймеров, проводили в программе-макросе GenAlex 6.5 для Excel. Результаты. Проведен анализ полиморфизма 16 генотипов редких реликтовых и исчезающих видов Allium с использованием 7 PBS-праймеров. Были получены четко различимые ампликоны, количество которых варьировало в зависимости от используемого праймера. Дендрограмма, основанная на анализе UPGMA, сгруппировала изучаемые генотипы в 2 основных кластера, в один из которых вошли образцы популяции A. altaicum, во второй кластер вошли образцы A. ledebourianum. A. microdictyon, представленный одним образцом, не вошел ни в один кластер, в дендрограмме сформировал базальную ветвь. В результате исследований была выявлена высокая степень iPBS-полиморфизма и генетического разнообразия редких реликтовых и исчезающих видов Allium. Практическая значимость. Использование молекулярно-генетического iPBS-метода позволяет выявить высокий уровень полиморфизма, который может служить основой для идентификации различных генотипов вида Allium, что позволит существенно дополнить традиционные методы сохранения естественных популяций данного рода.
Ключевые слова: Allium, популяция, ПЦР, молекулярные маркеры, iPBS, генотип, амплификация, кластерный анализ.
Для цитирования: Райзер О. Б., Хапилина О. Н. iPBS-полиморфизм редких реликтовых и исчезающих видов Allium, произрастающих на территории Казахстанского Алтая // Аграрный вестник Урала. 2020. № 09 (200). С. 63–73. DOI: 10.32417/1997-4868-2020-200-9-63-73.
