Авторы:
П. С. Богатова,
Г. А. Лиходеевский,
О. Е. Лиходеевская
Уральский государственный аграрный университет, Екатеринбург, Россия
E-mail:
Аннотация. Цель – изучить изменение инбридинга купного рогатого скота голштинской породы Свердловской области, выявить корреляционные взаимосвязи геномных оценок инбридинга с расчетными по родословным. Методы. Исследование проводили в шести племенных организациях Свердловской области на 512 коровах и телках 2007–2022 г. р. и 12 быках. Генотипирования проводили на чипах GGP Bovine 150K (Neogen, США) и Bovine 50K (Illumina, США). Оценки геномного инбридинга F были проведены в PLINK v1.9 функцией --het. Коэффициент инбридинга по регионам гомозиготности FROH был рассчитан с помощью метода «скользящего окна» пакета detectRUNS; FPED был взят из базы данных СЕЛЭКС, где он рассчитан по родословной с применением формулы Райта – Кисловского. Научная новизна. Впервые для крупного рогатого скота Свердловской области было проведено сравнение различных возрастных групп с помощью геномных оценок инбридинга и установлены корреляционные связи с инбридингом, рассчитанным по родословной. Результаты. По итогу исследовательской работы было обнаружено, что коэффициенты инбридинга значимо увеличиваются от младших возрастных групп к старшим. Максимальные же значения инбридинга достигаются в группе быков-производителей голштинской породы. В то же время уровень гетерозиготности, оцененный через sMLH, имеет тенденцию к снижению с возрастом. Также мы установили, что данные по инбридингу, рассчитанному по родословной (FPED), имеют наибольшую корреляцию с датой рождения особи. Помимо этого, FPED слабо коррелирует с геномными коэффициентами, при том что последние коррелируют между собой с высокой степенью достоверности.
Ключевые слова: крупный рогатый скот, инбридинг, ДКН-биочип, F, FROH, FPED, sMHL, голштинская порода
Благодарности. Исследование выполнено при поддержке Российского научного фонда, грант № 23-26- 00260 (регистрационный номер 123042000077-0).
Для цитирования: Богатова П. С., Лиходеевский Г. А., Лиходеевская О. Е. Взаимосвязь геномного и расчетного инбридинга в популяции крупного рогатого скота голштинской породы Свердловской области // Аграрный вестник Урала. 2024. Т. 24, № 09. С. 1158‒1171. https://doi.org/10.32417/1997-4868-2024-24-09-1158-1171.