Авторы: О. Н. Хапилина, А. С. Туржанова, О. Б. Райзер, Р. Н. Календарь
Национальный центр биотехнологии, Нур-Султан, Республика Казахстан, E-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Аннотация. Цель исследования – выделение изолятов Alternaria spp. и их PBS-дифференциация. В статье представлены результаты по выделению фитопатогенных грибов рода Alternaria spp. из растений пшеницы и их генетической дифференциации с использованием iPBS (Inter Primer Binding Site Polymorphism) анализа. В результате мониторинговых исследований показано, что грибы Alternaria spp. являются доминантным компонентом патокомплекса грибов, поражающих зародышевую зону семян и колосья пшеницы в северных регионах Казахстана. Патокомплекс альтернариоза сформирован изолятами А. alternata, А. infectoria и А. tenuissima. Методы. Генетическую дифференциацию изолятов проводили с использованием iPBS-анализа. Метод основан на использовании консервативных последовательностей сайтов связывания тРНК (Primer Binding Sites) в качестве ПЦР праймеров. Данный метод является универсальным и эффективным для непосредственного выявления полиморфизма между индивидуумами, поэтому PBS-праймеры могут быть использованы практически у любых организмов, в том числе и у грибов. Результаты. Анализ PBS праймеров показал, что все они имеют высокую разрешающую способность при дифференциации изолятов Alternaria spp. Полученные продукты амплификации показали высокую вариабельность среди изолятов как внутри одного вида, так и на межвидовом уровне. Уровень детектируемого полиморфизма варьировал от 47,43 % до 80,81 %, в среднем этот показатель составил 61 %. Размер амплифицированных ПЦР-фрагментов был в диапазоне от 200 до 3000 п. н., в среднем наблюдали амплификацию от 5 до 15 бендов на каждый изолят. Практическая значимость. Данная работа позволила получить новые данные о генетическом разнообразии фитопатогенных грибов Alternaria для последующей разработки стратегии защиты растений от альтернариоза.
Ключевые слова: пшеница, изолят, Alternaria spp., фитопатоген, альтернариоз, ПЦР, молекулярные маркеры, iPBS, амплификация.
Для цитирования: Хапилина О. Н., Туржанова А. С., Райзер О. Б., Календарь Р. Н. Выделение и PBS-дифференциация изолятов Alternaria spp. // Аграрный вестник Урала. 2020. № 10 (201). С. 64–72. DOI: 10.32417/1997-4868-2020-201-10- 64-72.
