Авторы:
М. В. Бытов,
Д. Ю. Нохрин,
В. Д. Зубарева,
А. Г. Исаева,
О. В. Соколова
Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук, Екатеринбург, Россия
E-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Аннотация. Воспалительные заболевания молочной железы продолжают оставаться наиболее распространенной проблемой среди коров молочных стад, несмотря на оптимизируемые профилактические меры и схемы лечения. Одним из способов предупреждения развития мастита у коров молочной продуктивности является генетическая селекция наиболее устойчивых к заболеванию особей. Для выявления генетических маркеров, связанных с развитием заболеваний, проводятся полногеномные ассоциативные исследования (genome-wide association study, GWAS). Их результатом являются полиморфные локусы в геноме, чей вклад в развитие заболевания является значительным. Однако для подтверждения достоверности результатов ассоциативных тестов необходимо проводить валидационные post-GWAS-исследования отдельных локусов в независимых выборках. Целью данной работы является проведение валидационного post-GWAS-исследования 5 однонуклеотидных полиморфизмов с риском развития мастита и создание предиктивных моделей развития данного заболевания для тагильской, суксунской и голштинской пород крупного рогатого скота. Методы. Генотипирование проведено с использованием наборов TaqMan для ПЦР в режиме реального времени. Статистическая обработка и построение моделей риска выполнены с помощью веб-инструмента SNPstats и программного пакета MDR. В результате статистического анализа установлено, что отдельные аллели полиморфизмов rs109452259, rs134055603 и rs137396952 предположительно обладают протекторным эффектом по отношению к развитию мастита у тагильской и суксунской пород. Обнаруженная зависимость была более выражена у суксунской породы. Отсутствие статистически значимых ассоциаций при анализе отдельных SNPs для голштинской породы может указывать на региональную генетическую вариабельность данной породы. Научная новизна работы состоит в получении новых сведений о степени генетической предрасположенности крупного рогатого скота, в том числе аборигенных исчезающих пород, к маститу по отдельным полиморфизмам. Увеличение количества изучаемых полиморфизмов в межгенном регионе GC-NPFFR2 для проведения post-GWAS-исследований позволит подтвердить достоверность связи данного локуса с развитием мастита, выявленную в предыдущих полногеномных ассоциативных исследованиях.
Ключевые слова: мастит, post-GWAS, крупный рогатый скот, тагильская порода, суксунская порода, голштинская порода, риск развития заболевания, ассоциативные тесты
Благодарности. Работа выполнена в рамках проекта РНФ № 22-16-00021 «Изучение ассоциаций молекулярно-генетических маркеров с ценными физиологическими признаками сельскохозяйственных животных с целью направленной селекции для повышения адаптационного потенциала и долголетия». Авторы выражают благодарность главному специалисту Управления сельского хозяйства и предпринимательства Октябрьского городского округа Пермского края В. М. Абсаликову, генеральному директору ООО «Суксунское» С. А. Пестрикову, директору ООО «Суксунское» Н. П. Суетиной за содействие в проведении научных исследований.
Для цитирования: Бытов М. В., Нохрин Д. Ю., Зубарева В. Д., Исаева А. Г., Соколова О. В. Post-GWAS-исследование предрасположенности коров разных пород к маститу // Аграрный вестник Урала. 2024. Т. 24, № 12. С. 1648‒1672. DOI: https://doi.org/10.32417/1997-4868-2024-24-12-1648-1672.
